共設25個機構，其中包括12個職能部門（辦公室（黨委辦公室）、黨群工作部 、戰(zhàn)略發(fā)展部、人力資源部、財務管理部、企業(yè)管理部、合約法規(guī)部、總工程師室、安全質(zhì)量監(jiān)察部、紀檢監(jiān)察部、審計部、工會），2個共享總部（后勤服務總部、采購物流總部），3個事業(yè)總部（建設事業(yè)總部、運營事業(yè)總部、經(jīng)營事業(yè)總部）及8個子公司（長春市地鐵有限責任公司、長春市輕軌房地產(chǎn)開發(fā)有限公司、長春市名典地鐵置業(yè)有限公司、長春市輕鐵廣告有限公司、長春市軌道交通預制構件有限責任公司、長春市泰萊輕軌建筑工程有限公司、中車長客城市軌道交通裝備服務有限責任公司、長影文化傳媒有限責任公司）。